[Todos] Fwd: CHARLA IFLYSIB: Martes 8/3 - 10:30 hs - Técnicas de ingeniería reversa aplicadas al ciclo de vida de Trypanosoma cruzi

Asistentes de Secretaria de Fisica secre2 en fisica.unlp.edu.ar
Jue Mar 3 10:17:38 ART 2016


 

-------- Mensaje original -------- 

		ASUNTO:
 		CHARLA IFLYSIB: Martes 8/3 - 10:30 hs - Técnicas de ingeniería
reversa aplicadas al ciclo de vida de Trypanosoma cruzi

		FECHA:
 		2016-03-03 10:17

		REMITENTE:
 		Charlas Iflysib <charlas.iflysib at gmail.com>

		DESTINATARIO:
 		academic at fcaglp.unlp.edu.ar, fcnym at museo.fcnym.unlp.edu.ar,
info at ciop.unlp.edu.ar, internet at biol.unlp.edu.ar, scyt at frlp.utn.edu.ar,
secre2 at fisica.unlp.edu.ar, secre at biol.unlp.edu.ar,
secre at mate.unlp.edu.ar, secretaria at inifta.unlp.edu.ar

Estimados: 

Agradecemos la difusión de la próxima charla del IFLYSIB. 

La comisión Chifly. 

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Hola a tod at s, 

L at s invitamos a la próxima charla del iflysib a realizarse el día martes
8/3 a las 10:30 hs. En esta oportunidad, Alejandra Carrea (CREG,
Facultad de Ciencias Exactas - UNLP) nos va hablar sobre: 

 Técnicas de ingeniería reversa aplicadas al ciclo de vida
de_Trypanosoma cruzi_ 

L at s esperamos con café y facturas! 

ATENCIÓN AL NUEVO HORARIO: 10:30 HS.

IFLYSIB (Instituto de Física de Líquidos y Sistemas Biológicos) 
Calle 59, 789 entre 10 y 11 

Comisión Chifly 

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 Técnicas de ingeniería reversa aplicadas al ciclo de vida
de_Trypanosoma cruzi_ 

Alejandra Carrea
 carrea.alejandra at gmail.com

Centro Regional de Estudios Genómicos (CREG) 
Facultad de Ciencias Exactas - UNLP

 Una de las cuestiones clave de la biología de sistemas consiste en
desarrollar marcos teóricos para comprender y esclarecer los circuitos
involucrados en la dinámica de diversos procesos celulares como la
diferenciación celular. Debido a los recientes avances logrados en la
reprogramación de fenotipos celulares, se ha dedicado mucho esfuerzo
para desarrollar procedimientos de ingeniería reversa que identifiquen
circuitos de redes regulatorias génicas (GRN) capaces de emular las
propiedades dinámicas asociadas con los destinos celulares de un
determinado sistema biológico. La estrategia de GRN es uno de los marcos
teóricos cuantitativos más usados en la actualidad para identificar
módulos de genes que controlan las transiciones entre distintos
fenotipos. Por otro lado, se sabe que los procesos celulares son
controlados por la actividad orquestada de miles de genes y sus
productos. Hoy en día esta actividad puede ser monitoreada mediante la
cuantificación de transcriptos de ARNm por técnicas de _microarrays_ o
secuenciación masiva, que ofrecen una visión general y completa de la
expresión génica de un determinado estado celular. En este trabajo
proponemos una estrategia computacional para reconstruir las GRN
responsables de las propiedades dinámicas observadas en un sistema
biológico complejo a partir de datos de expresión génica. El sistema en
estudio es el parásito _Trypanosoma cruzi (T. cruzi)_ y las propiedades
dinámicas corresponden a los 4 estados estacionarios, asociados con
fenotipos estables, y a las transiciones fenotípicas que ocurren durante
el ciclo de vida de _T. cruzi_. Nuestra estrategia se basa en un
ensamble de conjuntos de entrenamiento que se construye agregando ruido
a los niveles de expresión génica de los estados estacionarios y a las
transiciones existentes entre ellos. Como resultado pudimos reconstruir
una red regulatoria de 339 nodos cuya evolución temporal emula el perfil
transcripcional del parásito. Nuestro trabajo sugiere que una pequeña
sub-red formada por 7 nodos interconectados sería capaz de explicar la
dinámica del ciclo de vida de _T. cruzi_. Este tipo de modelos de redes
aporta conocimientos sobre las vías de señalización, predice la
respuesta de sistemas celulares a perturbaciones múltiples --más allá de
aquellas a partir de las que deriva el sistema--, y permitiría diseñar
perturbaciones para refinar el conocimiento que se tiene sobre la
arquitectura de la GRN. En el caso particular de _T. cruzi_, todo esto
podría ser de gran utilidad para identificar nuevos blancos terapéuticos
con posibles aplicaciones en la prevención o el tratamiento de la
enfermedad de Chagas. Además, la estrategia desarrollada podría servir
para comprender mejor otros organismos unicelulares con múltiples etapas
de desarrollo.

 -- 

COMISIÓN CHIFLY 
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 Si no estás interesado en recibir los avisos de las chiflys no dudes en
mandarnos un mensaje con el título: sacame de la lista ya!!! 
 
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